金石HPC集群方案在高校科研计算的实例应用
上海XX大学是国内顶尖的理工科院校,其材料科学与工程学院XX项目团队,主要从事相结构转变、形状记忆合金、固态弹热制冷、智能驱动器等方面研究,经常要对复杂的合金分子动力学计算模拟: 利用Lammps对XX合金的马氏体相变进行模拟研究。在进行模拟计算、数据精度,浮点运算能力、网络性能、存储性能都有很高要求,而单机计算计算时间较长,又影响工作进度,所以经过考虑,决定组建一个20台计算主机+1台存储的机器方案。在和团队的前期合作中,采用了双路XEON 8100系列,金石计算机KingHPC XS2208-D12作为集群计算单元和一台kingHPC NS2212-D12H存储,配合IB网络,大大提高计算成效。
近来,团队新上一个研究课题,需要扩展计算集群,在经过沟通后,金石计算机提供以下以XEON 铂金8300为核心的基础架构解决方案,KingHPC SX2204-D16在计算/存储架构、网络简洁、智能管理等方面进行全方位提升。单机高达64核心128线程为大规模并行计算提供了高效稳定的算力。
基本配置情况:
在科研领域,集群服务器的性能好坏主要取决于CPU、内存等各个方面,CPU的核心数量,主频睿频的范围,内存容量的大小,频率,作为服务器的核心部分,CPU承担了主要计算负载,intel第三代 至强最多可提供可提供40个核心,为了达到最高性价比,SX2204-D16提供了双路64核心128线程,该平台每插槽最多可支持6TB系统内存,高达16个DDR4-3200内存通道,完全满足一切计算需求。
在我们的方案中,采用了100G IB网络,实现了高速连接功能,这种高带宽、低延迟的高速网络进行集群节点间的通信,从而能够完美发挥集群的性能。
金石计算机是一家以“助力计算,服务科研”为使命,致力于计算机软、硬件开发和高端技术服务的高新技术企业。依托于强大的高校科研技术及世界前沿高科技应用技术,以“提供稳定、高效的软硬件产品与服务”为目标,专注于高性能计算技术(High Performance Computing)和数据安全存储技术整体解决方案,坚持“计算、存储一站服务”,为高校和科研院所以及Al创业人员提供超算算力(包括算力租赁)、通用算力、定制化算力、异构算力、数据安全存储以及相关配套服务的IT软、硬件整体解决、实施方案。